鑒于日本印刷行業管理的特色，日本印刷產業環保事業的推進，除了國家層面的組織機構外，印刷產業組織機構無疑發揮了更加全面的作用。其中，日本印刷產業聯合會針對印刷環保事業制定了《綠色印刷標志》等一系列行業規范及認證體系；日本推進印刷環境保護協會（E3PA）推出了《冰天使標志》環保印刷認證體系；日本生態印刷研究會推出了《印刷品環境標識原則》，正在制定《生態印刷證明書》體系；日本油墨工業聯合會推出自主規范及《NL標志》《植物油油墨標志》；日本無水膠印協會推出《蝴蝶標志》。

    《企業社會責任（CRS）》認證體系

    全日本印刷工業組合聯合會從2010年開始籌備印刷企業《企業社會責任（CRS）》認證體系，成立了CRS推進專業委員會負責具體實施，2013年正式推出CRS認證體系，并于6月25日發布第一批40家獲得認定的企業名單。

    CRS認證的目的是推進其會員企業強化社會責任，從合規性、環境、信息安全、質量、雇傭關系/勞動安全、財務/業績、社會貢獻/地域指向、信息公開/交流等8個方面考核企業承擔社會責任的具體措施，其中合規性、環境、信息安全3個方面是最重要的考核指標，實行一票否決制。

    CRS認證分為3個等級：1星為基本級，2星為較高級，3星為最高級。1星級認證主要是通過企業自主申報文件審查即可，2、3星則需要到企業現場審核。

    其中，1星級CRS認證的基本流程是：申報企業首先需要向“全印工聯”填報認證申請書，提交《開展CRS活動的項目考核表》的自我評價書，“全印工聯”的CRS認證委員會負責統籌，并委托橫濱市立大學CRS中心進行審核，通過后，集中分布認證結果。獲得認證的企業每兩年還需要進行年審。

    《冰天使標志》環保印刷認證體系

    日本推進印刷環境保護協會除了不斷完善《冰天使標志》環保印刷認證體系之外，還在積極推進數碼印刷認證、消減CO2貢獻度認證等。

    目前，《冰天使標志》環保印刷認證體系僅針對輪轉膠印和平張紙膠印，分別設有“銀、金、金+”3個級別。

    《冰天使標志》認證手續非常簡單，E3PA會員或準會員企業只要是按照《冰天使標志》環保印刷認證的標準生產的膠版印刷品，在《冰天使標志》環保印刷認證審查委員會備案后，都可以使用《冰天使標志》。

    《綠色印刷標志》 認證體系

    日本印刷產業聯合會從上世紀末就開始策劃制定綠色印刷標準，并于2001年8月發布第一個綠色印刷標準——《日印產聯〈膠版印刷服務〉綠色標準》，此后，陸續推出各種印刷方式的綠色標準，并不斷根據新的印刷環保要求加以修訂完善。目前，日本印刷產業聯合會的《綠色印刷標志》從標準到認證考核，再到評比頒獎，已經形成非常完整的、縝密的規范化體系。

    日本印刷產業聯合會的綠色印刷認證體系分成綠色印刷工廠認證、綠色印刷產品認證、綠色印刷器材認證等三大類。相應的《綠色印刷標志》分為1星、2星、3星共3個等級，星越多，則環保級別越高。